Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLMPQ9H6B4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLMPQ9H6B4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.6 ms