Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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BCL11BQ9C0K0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BCL11BQ9C0K0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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