Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD3Q9BZ95 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms