Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM54Q9BYV2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms