Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A9Q9BXP2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms