Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC106Q9BWC9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms