Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF4Q9BUZ4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms