Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM79Q9BSE2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms