Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms