Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NABP2Q9BQ15 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NABP2Q9BQ15 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms