Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms