Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CRBNQ96SW2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms