Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GPR78Q96P69 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPR78Q96P69 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms