Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
JSRP1Q96MG2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JSRP1Q96MG2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms