Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW1

AP2M1, AP-2 complex subunit mu, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2M1Q96CW1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AP2M1Q96CW1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms