Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMIGD2Q96BF3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms