Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms