Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED12Q93074 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MED12Q93074 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MED12Q93074 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MED12Q93074 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MED12Q93074 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED12Q93074 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED12Q93074 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED12Q93074 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MED12Q93074 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms