Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPAP2Q8IXW5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms