Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms