Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG4DQ86TL0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms