Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
WDR53Q7Z5U6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms