Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms