Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC141Q6ZP82 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC141Q6ZP82 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms