Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPOCD1Q6ZMY3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms