Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMIGD1Q6UXZ0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms