Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms