Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FRMPD1Q5SYB0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FRMPD1Q5SYB0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms