Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BRMS1LQ5PSV4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BRMS1LQ5PSV4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms