Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC27A3Q5K4L6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC27A3Q5K4L6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms