Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FGD3Q5JSP0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FGD3Q5JSP0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms