Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF628Q5EBL2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms