Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC153Q494R4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms