Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PCGF3Q3KNV8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCGF3Q3KNV8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms