Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AP5B1Q2VPB7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms