Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MSMPQ1L6U9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms