Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NRF1Q16656 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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NRF1Q16656 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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NRF1Q16656 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms