Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNAPC1Q16533 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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