Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms