Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC6Q16204 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC6Q16204 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms