Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NPTX1Q15818 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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