Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CDSNQ15517 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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