Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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RYR3Q15413 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RYR3Q15413 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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