Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PKP1Q13835 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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