Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RUNX3Q13761 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms