Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALCAMQ13740 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALCAMQ13740 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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