Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CUL3Q13618 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CUL3Q13618 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CUL3Q13618 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL3Q13618 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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