Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX6Q13608 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PEX6Q13608 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX6Q13608 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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