Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF5Q13568 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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IRF5Q13568 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF5Q13568 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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