Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EIF4EBP1Q13541 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms